Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5M5

TMC3, Transmembrane channel-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3Q7Z5M5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMC3Q7Z5M5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms