Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 BECN1-208ENST00000588276 769 ntTSL 35.97□□□□□ -1.459e-9■■■■■ 43.3
PRPF8Q6P2Q9 BECN1-209ENST00000589492 597 ntTSL 25.96□□□□□ -1.469e-9■■■■■ 43.3
PRPF8Q6P2Q9 CRLS1-206ENST00000489345 644 ntTSL 50.89□□□□□ -2.279e-12■■■■■ 43.3
PRPF8Q6P2Q9 SUN1-217ENST00000450538 570 ntTSL 413□□□□□ -0.331e-7■■■■■ 43.3
PRPF8Q6P2Q9 SUN1-211ENST00000427969 520 ntTSL 412.33□□□□□ -0.441e-7■■■■■ 43.3
PRPF8Q6P2Q9 YTHDF3-202ENST00000518373 524 ntTSL 47.77□□□□□ -1.178e-11■■■■■ 43.3
PRPF8Q6P2Q9 MRPS18B-206ENST00000259873 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.038e-7■■■■■ 43.3
PRPF8Q6P2Q9 MRPS18B-208ENST00000472267 1610 ntTSL 1 (best)8.61□□□□□ -1.038e-7■■■■■ 43.3
PRPF8Q6P2Q9 MRPS18B-207ENST00000472229 1409 ntTSL 37.98□□□□□ -1.138e-7■■■■■ 43.3
PRPF8Q6P2Q9 TRIP13-205ENST00000510412 571 ntTSL 58.65□□□□□ -1.023e-7■■■■■ 43.3
PRPF8Q6P2Q9 UBA1-209ENST00000490869 917 ntTSL 29.24□□□□□ -0.939e-7■■■■■ 43.2
PRPF8Q6P2Q9 SHMT2-211ENST00000554310 579 ntTSL 411.22□□□□□ -0.612e-7■■■■■ 43.2
PRPF8Q6P2Q9 SHMT2-230ENST00000557427 569 ntTSL 411.21□□□□□ -0.612e-7■■■■■ 43.2
PRPF8Q6P2Q9 SHMT2-209ENST00000553949 552 ntTSL 310.04□□□□□ -0.82e-7■■■■■ 43.2
PRPF8Q6P2Q9 FLNB-210ENST00000481470 6497 ntTSL 1 (best)8.4□□□□□ -1.073e-12■■■■■ 43.2
PRPF8Q6P2Q9 IFT122-208ENST00000502304 469 ntTSL 56.66□□□□□ -1.341e-10■■■■■ 43.2
PRPF8Q6P2Q9 IFT122-231ENST00000514275 296 ntTSL 53.56□□□□□ -1.841e-10■■■■■ 43.2
PRPF8Q6P2Q9 IFT122-209ENST00000502456 445 ntTSL 53.56□□□□□ -1.841e-10■■■■■ 43.2
PRPF8Q6P2Q9 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.912e-7■■■■■ 43.2
PRPF8Q6P2Q9 FBXO42-204ENST00000478089 2920 ntTSL 1 (best)5.28□□□□□ -1.562e-13■■■■■ 43.2
PRPF8Q6P2Q9 SAFB-204ENST00000586934 995 ntTSL 515.94■□□□□ 0.142e-8■■■■■ 43.2
PRPF8Q6P2Q9 ARFGAP3-204ENST00000453516 817 ntTSL 38.7□□□□□ -1.023e-6■■■■■ 43.2
PRPF8Q6P2Q9 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.62e-7■■■■■ 43.2
PRPF8Q6P2Q9 FLAD1-208ENST00000477609 554 ntTSL 510.61□□□□□ -0.712e-7■■■■■ 43.2
PRPF8Q6P2Q9 FLAD1-204ENST00000368428 1111 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.892e-7■■■■■ 43.2
PRPF8Q6P2Q9 POLE-202ENST00000416953 542 ntTSL 49.42□□□□□ -0.91e-11■■■■■ 43.2
PRPF8Q6P2Q9 FLAD1-211ENST00000489992 648 ntTSL 29.23□□□□□ -0.932e-7■■■■■ 43.2
PRPF8Q6P2Q9 PER2-204ENST00000491417 575 ntTSL 510.57□□□□□ -0.722e-16■■■■■ 43.2
PRPF8Q6P2Q9 UBP1-211ENST00000490112 633 ntTSL 59.3□□□□□ -0.923e-9■■■■■ 43.2
PRPF8Q6P2Q9 IKBKB-229ENST00000523599 1595 ntTSL 216.28■□□□□ 0.26e-11■■■■■ 43.2
PRPF8Q6P2Q9 IKBKB-221ENST00000522103 1575 ntTSL 214.8□□□□□ -0.046e-11■■■■■ 43.2
PRPF8Q6P2Q9 IKBKB-219ENST00000521225 260 ntTSL 35.62□□□□□ -1.516e-11■■■■■ 43.2
PRPF8Q6P2Q9 CLNS1A-206ENST00000526761 415 ntTSL 36.33□□□□□ -1.49e-18■■■■■ 43.2
PRPF8Q6P2Q9 NCOA3-205ENST00000497292 824 ntTSL 58.15□□□□□ -1.11e-8■■■■■ 43.1
PRPF8Q6P2Q9 IMMT-211ENST00000490238 699 ntTSL 45.56□□□□□ -1.522e-8■■■■■ 43.1
PRPF8Q6P2Q9 KIF2A-207ENST00000509663 759 ntTSL 316.59■□□□□ 0.257e-7■■■■■ 43.1
PRPF8Q6P2Q9 LPCAT4-202ENST00000562404 577 ntTSL 39.54□□□□□ -0.884e-6■■■■■ 43.1
PRPF8Q6P2Q9 SLC25A10-207ENST00000574129 1523 ntTSL 525.43■■□□□ 1.666e-8■■■■■ 43.1
PRPF8Q6P2Q9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.216e-8■■■■■ 43.1
PRPF8Q6P2Q9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.756e-8■■■■■ 43.1
PRPF8Q6P2Q9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.246e-8■■■■■ 43.1
PRPF8Q6P2Q9 PUM1-220ENST00000529846 683 ntTSL 34.35□□□□□ -1.717e-7■■■■■ 43.1
PRPF8Q6P2Q9 PUM1-216ENST00000525997 650 ntTSL 34.27□□□□□ -1.737e-7■■■■■ 43.1
PRPF8Q6P2Q9 HSPA8-220ENST00000533238 465 ntTSL 35.26□□□□□ -1.576e-8■■■■■ 43.1
PRPF8Q6P2Q9 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.591e-6■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.611e-6■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 IBTK-205ENST00000503400 5239 ntTSL 1 (best)4.83□□□□□ -1.641e-6■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 PMS1-203ENST00000409593 1668 ntTSL 1 (best)-0.79□□□□□ -2.542e-12■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 EHBP1-210ENST00000444311 460 ntTSL 53.82□□□□□ -1.83e-8■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 IVNS1ABP-207ENST00000480769 3776 ntTSL 1 (best)3.05□□□□□ -1.925e-8■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 HSPA8-208ENST00000526686 740 ntTSL 1 (best)1.16□□□□□ -2.223e-8■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 MSANTD3-202ENST00000374886 710 ntTSL 325.05■■□□□ 1.62e-11■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.522e-11■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 CCZ1B-213ENST00000496187 631 ntTSL 223.36■■□□□ 1.332e-11■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 CCZ1B-205ENST00000464543 748 ntTSL 223.09■■□□□ 1.292e-11■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 CCZ1B-211ENST00000486840 545 ntTSL 222.58■■□□□ 1.22e-11■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 MSANTD3-204ENST00000398977 780 ntTSL 321.85■■□□□ 1.092e-11■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 CCZ1B-202ENST00000411858 571 ntTSL 521.01■□□□□ 0.952e-11■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.836e-22■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.782e-11■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.786e-22■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.432e-11■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 HPS4-213ENST00000483631 737 ntTSL 317.22■□□□□ 0.352e-11■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.252e-11■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 DENND4A-208ENST00000568515 2655 ntTSL 215.81■□□□□ 0.122e-11■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.012e-11■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.022e-11■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.091e-9■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 KLHL7-206ENST00000459661 592 ntTSL 514.48□□□□□ -0.092e-11■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11e-9■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 JPX-213ENST00000640437 1620 ntTSL 513.76□□□□□ -0.212e-11■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 GDAP2-206ENST00000494224 730 ntTSL 313.17□□□□□ -0.32e-11■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 KLHL7-210ENST00000479288 616 ntTSL 412.87□□□□□ -0.352e-11■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 RMDN1-207ENST00000518772 796 ntTSL 212.6□□□□□ -0.392e-11■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 UCK1-207ENST00000484876 715 ntTSL 212.19□□□□□ -0.462e-11■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.582e-11■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 LRRFIP2-204ENST00000416425 961 ntTSL 311.34□□□□□ -0.592e-11■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 SRPRA-202ENST00000527817 687 ntTSL 211.08□□□□□ -0.642e-11■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 BTN2A3P-202ENST00000463944 533 ntTSL 410.84□□□□□ -0.672e-11■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 FAM161A-201ENST00000307507 1897 ntTSL 210.8□□□□□ -0.682e-11■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.722e-11■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 JPX-207ENST00000602772 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.762e-11■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 INPP4A-207ENST00000467042 869 ntTSL 510.28□□□□□ -0.762e-11■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 RSRC2-217ENST00000531389 1376 ntTSL 59.78□□□□□ -0.842e-11■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 FAM161A-203ENST00000405894 3684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.872e-11■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 BTN2A3P-205ENST00000475151 579 ntTSL 49.58□□□□□ -0.882e-11■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 HPS4-212ENST00000481910 1914 ntTSL 29.52□□□□□ -0.882e-11■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 FAM161A-205ENST00000456262 3579 ntTSL 1 (best)9.41□□□□□ -0.92e-11■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.932e-11■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 KLHL7-213ENST00000521082 3165 ntTSL 1 (best)9.02□□□□□ -0.972e-11■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 AP3S2-209ENST00000559162 357 ntTSL 29□□□□□ -0.972e-11■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 RMDN1-217ENST00000523370 543 ntTSL 48.97□□□□□ -0.972e-11■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 JPX-205ENST00000602546 762 ntTSL 38.48□□□□□ -1.052e-11■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 JPX-208ENST00000602895 829 ntTSL 38.4□□□□□ -1.072e-11■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 BTN2A3P-203ENST00000465856 2483 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.132e-11■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 ZNF644-202ENST00000347275 2036 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.152e-11■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 JPX-209ENST00000602920 625 ntTSL 27.82□□□□□ -1.162e-11■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 LARP7-201ENST00000324052 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.172e-11■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 HPS5-206ENST00000531848 2160 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.182e-11■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 BTN2A3P-204ENST00000466808 2559 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.222e-11■■■■■ 43
Retrieved 100 of 73,762 protein–RNA pairs in 653.8 ms