Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms