Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms