Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms