Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q1T7F1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q1T7F1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q1T7F1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Q1T7F1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q1T7F1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q1T7F1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q1T7F1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q1T7F1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Q1T7F1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q1T7F1 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q1T7F1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q1T7F1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q1T7F1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q1T7F1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q1T7F1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q1T7F1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q1T7F1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q1T7F1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q1T7F1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q1T7F1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q1T7F1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q1T7F1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q1T7F1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q1T7F1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q1T7F1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Q1T7F1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q1T7F1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q1T7F1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q1T7F1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q1T7F1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q1T7F1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q1T7F1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q1T7F1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q1T7F1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q1T7F1 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q1T7F1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q1T7F1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q1T7F1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q1T7F1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q1T7F1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q1T7F1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q1T7F1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q1T7F1 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q1T7F1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q1T7F1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q1T7F1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q1T7F1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q1T7F1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Q1T7F1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q1T7F1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q1T7F1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q1T7F1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q1T7F1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q1T7F1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q1T7F1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q1T7F1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q1T7F1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q1T7F1 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q1T7F1 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q1T7F1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q1T7F1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q1T7F1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q1T7F1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q1T7F1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q1T7F1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q1T7F1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q1T7F1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q1T7F1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q1T7F1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q1T7F1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q1T7F1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q1T7F1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q1T7F1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q1T7F1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q1T7F1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q1T7F1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q1T7F1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q1T7F1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q1T7F1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q1T7F1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q1T7F1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q1T7F1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q1T7F1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q1T7F1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q1T7F1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q1T7F1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q1T7F1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q1T7F1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Q1T7F1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q1T7F1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q1T7F1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q1T7F1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q1T7F1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q1T7F1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q1T7F1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q1T7F1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q1T7F1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q1T7F1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q1T7F1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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