Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EGR3Q06889 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms