Protein–RNA interactions for Protein: P62491

RAB11A, Ras-related protein Rab-11A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11AP62491 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11AP62491 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms