Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms