Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTXN1P60606 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms