Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms