Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP62P37198 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP62P37198 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP62P37198 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP62P37198 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP62P37198 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP62P37198 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP62P37198 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP62P37198 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP62P37198 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP62P37198 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP62P37198 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP62P37198 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
NUP62P37198 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP62P37198 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP62P37198 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP62P37198 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP62P37198 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP62P37198 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP62P37198 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP62P37198 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP62P37198 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP62P37198 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP62P37198 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP62P37198 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP62P37198 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP62P37198 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP62P37198 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP62P37198 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP62P37198 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP62P37198 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP62P37198 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP62P37198 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP62P37198 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP62P37198 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP62P37198 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP62P37198 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP62P37198 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP62P37198 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP62P37198 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP62P37198 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP62P37198 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP62P37198 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP62P37198 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP62P37198 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP62P37198 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP62P37198 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP62P37198 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP62P37198 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP62P37198 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP62P37198 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP62P37198 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP62P37198 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP62P37198 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP62P37198 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP62P37198 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP62P37198 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP62P37198 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP62P37198 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP62P37198 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP62P37198 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP62P37198 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP62P37198 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP62P37198 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP62P37198 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP62P37198 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP62P37198 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP62P37198 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP62P37198 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP62P37198 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP62P37198 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP62P37198 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP62P37198 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP62P37198 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP62P37198 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP62P37198 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP62P37198 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP62P37198 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP62P37198 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP62P37198 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP62P37198 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP62P37198 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP62P37198 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP62P37198 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP62P37198 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP62P37198 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP62P37198 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP62P37198 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP62P37198 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP62P37198 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP62P37198 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP62P37198 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP62P37198 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP62P37198 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP62P37198 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP62P37198 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP62P37198 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP62P37198 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP62P37198 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP62P37198 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms