Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCSHP23434 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCSHP23434 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCSHP23434 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCSHP23434 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCSHP23434 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCSHP23434 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCSHP23434 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCSHP23434 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCSHP23434 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCSHP23434 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCSHP23434 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCSHP23434 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCSHP23434 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCSHP23434 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCSHP23434 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCSHP23434 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCSHP23434 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCSHP23434 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCSHP23434 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCSHP23434 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCSHP23434 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCSHP23434 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCSHP23434 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCSHP23434 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCSHP23434 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCSHP23434 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCSHP23434 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCSHP23434 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCSHP23434 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCSHP23434 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCSHP23434 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCSHP23434 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCSHP23434 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCSHP23434 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCSHP23434 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCSHP23434 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCSHP23434 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCSHP23434 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCSHP23434 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCSHP23434 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GCSHP23434 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCSHP23434 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCSHP23434 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCSHP23434 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCSHP23434 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCSHP23434 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCSHP23434 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCSHP23434 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCSHP23434 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCSHP23434 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCSHP23434 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCSHP23434 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCSHP23434 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCSHP23434 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCSHP23434 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCSHP23434 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GCSHP23434 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCSHP23434 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCSHP23434 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCSHP23434 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCSHP23434 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCSHP23434 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCSHP23434 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCSHP23434 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCSHP23434 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCSHP23434 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCSHP23434 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCSHP23434 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCSHP23434 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCSHP23434 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCSHP23434 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GCSHP23434 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GCSHP23434 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GCSHP23434 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GCSHP23434 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GCSHP23434 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GCSHP23434 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSHP23434 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSHP23434 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSHP23434 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSHP23434 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSHP23434 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSHP23434 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSHP23434 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSHP23434 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSHP23434 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSHP23434 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSHP23434 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSHP23434 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSHP23434 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSHP23434 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSHP23434 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSHP23434 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSHP23434 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSHP23434 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSHP23434 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSHP23434 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSHP23434 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSHP23434 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms