Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF3P20783 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF3P20783 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF3P20783 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF3P20783 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF3P20783 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF3P20783 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF3P20783 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF3P20783 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF3P20783 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF3P20783 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF3P20783 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF3P20783 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF3P20783 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF3P20783 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF3P20783 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF3P20783 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF3P20783 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF3P20783 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF3P20783 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF3P20783 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF3P20783 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF3P20783 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF3P20783 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF3P20783 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF3P20783 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF3P20783 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF3P20783 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF3P20783 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF3P20783 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF3P20783 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF3P20783 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF3P20783 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF3P20783 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF3P20783 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF3P20783 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF3P20783 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF3P20783 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF3P20783 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF3P20783 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF3P20783 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF3P20783 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NTF3P20783 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NTF3P20783 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NTF3P20783 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NTF3P20783 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NTF3P20783 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NTF3P20783 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTF3P20783 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTF3P20783 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTF3P20783 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTF3P20783 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTF3P20783 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTF3P20783 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTF3P20783 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTF3P20783 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTF3P20783 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTF3P20783 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTF3P20783 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTF3P20783 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTF3P20783 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTF3P20783 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTF3P20783 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTF3P20783 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF3P20783 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF3P20783 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF3P20783 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF3P20783 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF3P20783 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF3P20783 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF3P20783 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF3P20783 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF3P20783 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF3P20783 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF3P20783 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF3P20783 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF3P20783 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF3P20783 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF3P20783 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF3P20783 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF3P20783 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF3P20783 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF3P20783 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF3P20783 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF3P20783 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF3P20783 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF3P20783 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTF3P20783 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTF3P20783 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTF3P20783 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTF3P20783 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTF3P20783 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTF3P20783 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTF3P20783 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTF3P20783 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTF3P20783 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTF3P20783 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NTF3P20783 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTF3P20783 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTF3P20783 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms