Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD28P10747 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD28P10747 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD28P10747 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD28P10747 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD28P10747 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD28P10747 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD28P10747 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD28P10747 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD28P10747 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD28P10747 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD28P10747 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD28P10747 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD28P10747 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD28P10747 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD28P10747 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD28P10747 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD28P10747 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD28P10747 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD28P10747 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD28P10747 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD28P10747 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD28P10747 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD28P10747 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD28P10747 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD28P10747 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD28P10747 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD28P10747 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD28P10747 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD28P10747 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD28P10747 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD28P10747 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD28P10747 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD28P10747 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD28P10747 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD28P10747 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD28P10747 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD28P10747 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD28P10747 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD28P10747 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CD28P10747 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD28P10747 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD28P10747 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD28P10747 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD28P10747 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD28P10747 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD28P10747 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD28P10747 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD28P10747 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD28P10747 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD28P10747 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD28P10747 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD28P10747 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD28P10747 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD28P10747 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD28P10747 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD28P10747 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD28P10747 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD28P10747 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD28P10747 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD28P10747 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD28P10747 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD28P10747 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD28P10747 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CD28P10747 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD28P10747 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD28P10747 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD28P10747 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD28P10747 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD28P10747 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD28P10747 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD28P10747 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD28P10747 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD28P10747 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CD28P10747 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CD28P10747 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD28P10747 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD28P10747 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD28P10747 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD28P10747 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD28P10747 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CD28P10747 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD28P10747 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD28P10747 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CD28P10747 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD28P10747 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD28P10747 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD28P10747 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD28P10747 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD28P10747 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD28P10747 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD28P10747 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD28P10747 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD28P10747 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD28P10747 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD28P10747 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD28P10747 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD28P10747 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD28P10747 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD28P10747 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms