Protein–RNA interactions for Protein: P02100

HBE1, Hemoglobin subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBE1P02100 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HBE1P02100 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HBE1P02100 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HBE1P02100 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HBE1P02100 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HBE1P02100 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HBE1P02100 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HBE1P02100 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HBE1P02100 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HBE1P02100 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HBE1P02100 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HBE1P02100 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HBE1P02100 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HBE1P02100 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HBE1P02100 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HBE1P02100 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HBE1P02100 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HBE1P02100 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HBE1P02100 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HBE1P02100 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HBE1P02100 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HBE1P02100 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HBE1P02100 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HBE1P02100 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HBE1P02100 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HBE1P02100 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HBE1P02100 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HBE1P02100 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HBE1P02100 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HBE1P02100 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HBE1P02100 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HBE1P02100 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HBE1P02100 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HBE1P02100 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HBE1P02100 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HBE1P02100 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HBE1P02100 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HBE1P02100 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HBE1P02100 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HBE1P02100 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HBE1P02100 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HBE1P02100 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HBE1P02100 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HBE1P02100 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HBE1P02100 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HBE1P02100 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HBE1P02100 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HBE1P02100 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HBE1P02100 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HBE1P02100 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HBE1P02100 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HBE1P02100 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HBE1P02100 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HBE1P02100 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HBE1P02100 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HBE1P02100 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HBE1P02100 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HBE1P02100 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HBE1P02100 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HBE1P02100 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HBE1P02100 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HBE1P02100 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HBE1P02100 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HBE1P02100 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HBE1P02100 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HBE1P02100 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HBE1P02100 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HBE1P02100 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HBE1P02100 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HBE1P02100 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HBE1P02100 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HBE1P02100 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HBE1P02100 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HBE1P02100 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HBE1P02100 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HBE1P02100 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HBE1P02100 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HBE1P02100 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HBE1P02100 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HBE1P02100 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HBE1P02100 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HBE1P02100 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HBE1P02100 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HBE1P02100 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HBE1P02100 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HBE1P02100 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HBE1P02100 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HBE1P02100 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HBE1P02100 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HBE1P02100 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HBE1P02100 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HBE1P02100 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HBE1P02100 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HBE1P02100 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HBE1P02100 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HBE1P02100 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HBE1P02100 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HBE1P02100 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HBE1P02100 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HBE1P02100 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms