Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA2O43364 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms