Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms