Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP290O15078 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP290O15078 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP290O15078 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP290O15078 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP290O15078 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP290O15078 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP290O15078 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP290O15078 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP290O15078 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP290O15078 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP290O15078 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP290O15078 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP290O15078 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP290O15078 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP290O15078 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP290O15078 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP290O15078 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP290O15078 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP290O15078 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP290O15078 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP290O15078 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CEP290O15078 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CEP290O15078 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CEP290O15078 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CEP290O15078 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CEP290O15078 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CEP290O15078 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CEP290O15078 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP290O15078 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP290O15078 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP290O15078 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP290O15078 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP290O15078 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP290O15078 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP290O15078 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP290O15078 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP290O15078 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP290O15078 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP290O15078 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP290O15078 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP290O15078 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP290O15078 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP290O15078 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP290O15078 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP290O15078 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP290O15078 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP290O15078 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP290O15078 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP290O15078 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP290O15078 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP290O15078 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP290O15078 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP290O15078 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP290O15078 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP290O15078 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP290O15078 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP290O15078 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP290O15078 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP290O15078 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP290O15078 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP290O15078 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP290O15078 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP290O15078 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP290O15078 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP290O15078 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP290O15078 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP290O15078 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP290O15078 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP290O15078 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP290O15078 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP290O15078 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP290O15078 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP290O15078 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP290O15078 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP290O15078 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP290O15078 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP290O15078 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP290O15078 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP290O15078 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP290O15078 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP290O15078 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP290O15078 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP290O15078 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP290O15078 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP290O15078 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP290O15078 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP290O15078 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP290O15078 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP290O15078 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP290O15078 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP290O15078 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP290O15078 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP290O15078 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP290O15078 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP290O15078 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP290O15078 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP290O15078 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP290O15078 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP290O15078 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
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