Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLGNO14967 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLGNO14967 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLGNO14967 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLGNO14967 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLGNO14967 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLGNO14967 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CLGNO14967 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLGNO14967 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLGNO14967 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLGNO14967 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLGNO14967 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLGNO14967 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CLGNO14967 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLGNO14967 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLGNO14967 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLGNO14967 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLGNO14967 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLGNO14967 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLGNO14967 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CLGNO14967 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLGNO14967 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLGNO14967 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLGNO14967 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLGNO14967 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLGNO14967 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CLGNO14967 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CLGNO14967 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLGNO14967 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLGNO14967 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLGNO14967 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLGNO14967 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLGNO14967 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLGNO14967 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLGNO14967 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CLGNO14967 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLGNO14967 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CLGNO14967 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLGNO14967 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLGNO14967 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLGNO14967 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLGNO14967 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CLGNO14967 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLGNO14967 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLGNO14967 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLGNO14967 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLGNO14967 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLGNO14967 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLGNO14967 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLGNO14967 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLGNO14967 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLGNO14967 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLGNO14967 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLGNO14967 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLGNO14967 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLGNO14967 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLGNO14967 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLGNO14967 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLGNO14967 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLGNO14967 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLGNO14967 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLGNO14967 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLGNO14967 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CLGNO14967 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CLGNO14967 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLGNO14967 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLGNO14967 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLGNO14967 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLGNO14967 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLGNO14967 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLGNO14967 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLGNO14967 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLGNO14967 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLGNO14967 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLGNO14967 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLGNO14967 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLGNO14967 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLGNO14967 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLGNO14967 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CLGNO14967 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLGNO14967 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLGNO14967 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLGNO14967 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLGNO14967 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLGNO14967 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLGNO14967 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLGNO14967 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLGNO14967 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLGNO14967 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLGNO14967 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CLGNO14967 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CLGNO14967 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CLGNO14967 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLGNO14967 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLGNO14967 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CLGNO14967 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLGNO14967 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLGNO14967 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLGNO14967 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLGNO14967 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms