Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms