Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VPS37CA5D8V6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms