Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 MCM5-206ENST00000451351 450 ntTSL 49.62□□□□□ -0.879e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 STIP1-211ENST00000543847 772 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.919e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 CWC15-202ENST00000539856 905 ntTSL 29.27□□□□□ -0.939e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 POLG-223ENST00000637307 100 ntTSL 59.03□□□□□ -0.969e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 MSL3-202ENST00000337339 3446 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.969e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 ANKS3-208ENST00000586632 553 ntTSL 48.28□□□□□ -1.089e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 MSL3-205ENST00000380692 1071 ntTSL 38.26□□□□□ -1.099e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 MSL3-203ENST00000361672 2256 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.159e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 MSL3-201ENST00000312196 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.169e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 MSL3-206ENST00000380693 2377 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.289e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 VAMP7-205ENST00000479687 742 ntTSL 56.4□□□□□ -1.389e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 MSL3-210ENST00000468149 1646 ntTSL 26.34□□□□□ -1.399e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 TMEM183A-202ENST00000463015 755 ntTSL 25.9□□□□□ -1.469e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 MSL3-204ENST00000380691 589 ntTSL 35.31□□□□□ -1.569e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 VAMP7-204ENST00000463317 673 ntTSL 55.23□□□□□ -1.579e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 UCHL5-207ENST00000416915 411 ntTSL 34.75□□□□□ -1.659e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 MCM5-204ENST00000417343 557 ntTSL 54.71□□□□□ -1.669e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 ANAPC4-209ENST00000507925 731 ntTSL 34.05□□□□□ -1.769e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 FUBP3-202ENST00000465949 676 ntTSL 54□□□□□ -1.779e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 KMT5B-211ENST00000458496 556 ntTSL 423.63■■□□□ 1.374e-9■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 KMT5B-210ENST00000453170 594 ntTSL 522.89■■□□□ 1.254e-9■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 KMT5B-208ENST00000434573 585 ntTSL 415.85■□□□□ 0.134e-9■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 CUL2-205ENST00000374754 4440 ntTSL 515.49■□□□□ 0.074e-9■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 ADIPOR1-204ENST00000426229 879 ntTSL 214.37□□□□□ -0.114e-9■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 CUL2-210ENST00000626172 4115 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.414e-9■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 CUL2-203ENST00000374749 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.794e-9■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 CUL2-202ENST00000374748 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.894e-9■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 RABGAP1L-222ENST00000635248 3074 ntTSL 59.35□□□□□ -0.914e-9■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 CUL2-204ENST00000374751 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.984e-9■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 RABGAP1L-221ENST00000529474 524 ntTSL 45.65□□□□□ -1.54e-9■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.734e-9■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.764e-9■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.914e-9■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 DDX17-206ENST00000467279 712 ntTSL 521.43■■□□□ 1.023e-14■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.492e-11■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 ATAD5-201ENST00000321990 6869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.681e-6■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 ATAD5-202ENST00000578295 4051 ntTSL 1 (best)9.78□□□□□ -0.841e-6■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 ATAD5-203ENST00000585133 2686 ntTSL 22.63□□□□□ -1.991e-6■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 SORT1-204ENST00000482236 615 ntTSL 310.31□□□□□ -0.766e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.482e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.572e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 PDXDC1-214ENST00000566633 2597 ntTSL 29.79□□□□□ -0.842e-12■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 TTC19-208ENST00000497842 1360 ntTSL 525.49■■□□□ 1.675e-6■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 TTC19-206ENST00000475723 2591 ntTSL 220.98■□□□□ 0.955e-6■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.575e-6■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 TTC19-207ENST00000481107 3075 ntTSL 26.77□□□□□ -1.335e-6■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 TTC19-202ENST00000465567 2801 ntTSL 1 (best)4.68□□□□□ -1.665e-6■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC5.88□□□□□ -1.472e-44■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 NECAB3-205ENST00000473892 438 ntTSL 212.54□□□□□ -0.43e-6■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.619e-8■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 ZNF37BP-204ENST00000473592 2929 ntTSL 1 (best)16.28■□□□□ 0.29e-8■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 ZNF37BP-202ENST00000452075 8637 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.839e-8■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 BIRC6-209ENST00000471232 4226 ntTSL 25.89□□□□□ -1.479e-8■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 RALGAPA1-212ENST00000556106 1029 ntTSL 55.74□□□□□ -1.499e-8■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 RALGAPA1-208ENST00000554573 2358 ntTSL 53.11□□□□□ -1.919e-8■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 RALGAPA1-206ENST00000554259 3354 ntTSL 52.35□□□□□ -2.039e-8■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 ZNF451-209ENST00000502749 790 ntTSL 517.64■□□□□ 0.412e-6■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 COMT-208ENST00000428707 724 ntTSL 312.59□□□□□ -0.396e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 MVD-203ENST00000562651 908 ntTSL 218.52■□□□□ 0.561e-6■□□□□ 10.6
SF3B4Q15427 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.714e-6■□□□□ 10.6
SF3B4Q15427 AC104452.1-208ENST00000636461 5083 ntTSL 516.95■□□□□ 0.32e-6■□□□□ 10.6
SF3B4Q15427 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.084e-6■□□□□ 10.6
SF3B4Q15427 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.122e-6■□□□□ 10.6
SF3B4Q15427 ACCS-209ENST00000531940 1234 ntTSL 513.59□□□□□ -0.234e-6■□□□□ 10.6
SF3B4Q15427 NICN1-203ENST00000423832 2040 ntTSL 513.5□□□□□ -0.254e-6■□□□□ 10.6
SF3B4Q15427 ELP2-218ENST00000541748 674 ntTSL 213.03□□□□□ -0.324e-6■□□□□ 10.6
SF3B4Q15427 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.394e-6■□□□□ 10.6
SF3B4Q15427 AC104452.1-205ENST00000638079 3146 ntTSL 512.46□□□□□ -0.412e-6■□□□□ 10.6
SF3B4Q15427 AC104452.1-206ENST00000637088 6740 ntTSL 512.09□□□□□ -0.472e-6■□□□□ 10.6
SF3B4Q15427 ELP2-227ENST00000545302 635 ntTSL 211.85□□□□□ -0.514e-6■□□□□ 10.6
SF3B4Q15427 ELP2-209ENST00000536830 636 ntTSL 211.72□□□□□ -0.534e-6■□□□□ 10.6
SF3B4Q15427 AC104452.1-201ENST00000638115 4453 ntTSL 511.13□□□□□ -0.632e-6■□□□□ 10.6
SF3B4Q15427 NICN1-208ENST00000615713 1921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.74e-6■□□□□ 10.6
SF3B4Q15427 AC104452.1-207ENST00000638014 4510 ntTSL 510.31□□□□□ -0.762e-6■□□□□ 10.6
SF3B4Q15427 NICN1-207ENST00000497742 1743 ntTSL 510.07□□□□□ -0.84e-6■□□□□ 10.6
SF3B4Q15427 ELP2-226ENST00000544274 414 ntTSL 26.53□□□□□ -1.364e-6■□□□□ 10.6
SF3B4Q15427 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.724e-6■□□□□ 10.6
SF3B4Q15427 EEF1AKMT2-202ENST00000464099 1013 ntTSL 1 (best)23.54■■□□□ 1.361e-7■□□□□ 10.6
SF3B4Q15427 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.231e-7■□□□□ 10.6
SF3B4Q15427 EEF1AKMT2-203ENST00000466270 3587 ntTSL 1 (best)15.23■□□□□ 0.031e-7■□□□□ 10.6
SF3B4Q15427 AC068896.1-201ENST00000494792 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.481e-7■□□□□ 10.6
SF3B4Q15427 SLC37A3-204ENST00000460560 2111 ntTSL 516.55■□□□□ 0.241e-6■□□□□ 10.6
SF3B4Q15427 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.411e-6■□□□□ 10.6
SF3B4Q15427 SLC37A3-203ENST00000447932 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.571e-6■□□□□ 10.6
SF3B4Q15427 SLC37A3-215ENST00000477571 3488 ntTSL 59.46□□□□□ -0.91e-6■□□□□ 10.6
SF3B4Q15427 SLC37A3-202ENST00000340308 2955 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.131e-6■□□□□ 10.6
SF3B4Q15427 SLC37A3-219ENST00000485734 578 ntTSL 44.37□□□□□ -1.711e-6■□□□□ 10.6
SF3B4Q15427 NAPA-215ENST00000597271 1467 ntTSL 216.92■□□□□ 0.31e-10■□□□□ 10.6
SF3B4Q15427 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.151e-10■□□□□ 10.6
SF3B4Q15427 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.181e-6■□□□□ 10.6
SF3B4Q15427 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.261e-10■□□□□ 10.6
SF3B4Q15427 THOC5-204ENST00000397873 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.621e-10■□□□□ 10.6
SF3B4Q15427 THOC5-210ENST00000443089 786 ntTSL 29.46□□□□□ -0.91e-10■□□□□ 10.6
SF3B4Q15427 NAPA-207ENST00000594217 554 ntTSL 58.81□□□□□ -11e-10■□□□□ 10.6
SF3B4Q15427 THOC5-201ENST00000358079 2427 ntTSL 58.66□□□□□ -1.021e-10■□□□□ 10.6
SF3B4Q15427 RTF1-206ENST00000560447 551 ntTSL 38.66□□□□□ -1.021e-6■□□□□ 10.6
SF3B4Q15427 THOC5-216ENST00000490103 4753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.151e-10■□□□□ 10.6
SF3B4Q15427 RABGAP1L-211ENST00000465412 710 ntTSL 56.97□□□□□ -1.291e-10■□□□□ 10.6
SF3B4Q15427 THOC5-214ENST00000484924 909 ntTSL 56.96□□□□□ -1.31e-10■□□□□ 10.6
SF3B4Q15427 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.381e-10■□□□□ 10.6
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