Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.772e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.642e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 PPP5C-206ENST00000486994 2209 ntTSL 217.73■□□□□ 0.432e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.352e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 MOGS-207ENST00000462443 532 ntTSL 216.97■□□□□ 0.312e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 MOGS-204ENST00000448666 1616 ntTSL 1 (best)16.71■□□□□ 0.272e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.242e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.232e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.232e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.192e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.142e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 L3MBTL1-211ENST00000457824 582 ntTSL 315.88■□□□□ 0.132e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 ANK1-204ENST00000335651 525 ntTSL 415.61■□□□□ 0.092e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 AHI1-214ENST00000531527 516 ntTSL 315.33■□□□□ 0.042e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 AHI1-210ENST00000524469 1074 ntTSL 515.29■□□□□ 0.042e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.012e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 LRRFIP2-208ENST00000438374 560 ntTSL 414.53□□□□□ -0.082e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 PPP5C-203ENST00000467502 1235 ntTSL 214.52□□□□□ -0.092e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 PSTPIP2-203ENST00000588801 1023 ntTSL 514.4□□□□□ -0.12e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 L3MBTL1-207ENST00000430781 903 ntTSL 1 (best)14.34□□□□□ -0.112e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.122e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.142e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 MOGS-206ENST00000462189 2400 ntTSL 213.86□□□□□ -0.192e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 PPP5C-207ENST00000487483 4675 ntTSL 513.76□□□□□ -0.212e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 MOGS-203ENST00000414701 520 ntTSL 313.4□□□□□ -0.262e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 PPP5C-210ENST00000493347 431 ntTSL 313.32□□□□□ -0.282e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 PPP5C-214ENST00000532058 1970 ntTSL 413.24□□□□□ -0.292e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.322e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 PPP5C-205ENST00000478046 1886 ntTSL 1 (best)13.04□□□□□ -0.322e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 AAAS-205ENST00000546572 582 ntTSL 212.68□□□□□ -0.382e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.422e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 MMP17-205ENST00000535271 633 ntTSL 212.36□□□□□ -0.432e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.462e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.472e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 PSTPIP2-202ENST00000587042 859 ntTSL 211.93□□□□□ -0.52e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 PABPC1-205ENST00000518196 631 ntTSL 311.7□□□□□ -0.542e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 HAUS6-202ENST00000380502 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.582e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 PSTPIP2-201ENST00000409746 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.72e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 NDUFS3-204ENST00000525378 779 ntTSL 210.69□□□□□ -0.72e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 ANK1-208ENST00000518715 547 ntTSL 410.5□□□□□ -0.732e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 SRP9-202ENST00000366838 540 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.752e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 STRN3-203ENST00000366206 575 ntTSL 410.05□□□□□ -0.82e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 PSTPIP2-204ENST00000589328 2900 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.852e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 PABPC1-203ENST00000517921 885 ntTSL 59.33□□□□□ -0.922e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 HAUS6-201ENST00000380496 3756 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.942e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 SRP9-205ENST00000626563 329 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.952e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 NUP54-203ENST00000504173 314 ntTSL 39□□□□□ -0.972e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 PABPC1-222ENST00000523555 522 ntTSL 38.54□□□□□ -1.042e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 LRRFIP2-206ENST00000434749 718 ntTSL 57.89□□□□□ -1.152e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 LRRFIP2-207ENST00000436858 389 ntTSL 57.89□□□□□ -1.152e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 LRRFIP2-211ENST00000452742 352 ntTSL 57.89□□□□□ -1.152e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 NDUFS3-205ENST00000527178 269 ntTSL 27.88□□□□□ -1.152e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 RNF216-209ENST00000484458 492 ntTSL 57.53□□□□□ -1.24e-14■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 STRBP-206ENST00000478973 663 ntTSL 57.12□□□□□ -1.272e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 PPP1CC-210ENST00000553024 2797 ntTSL 26.98□□□□□ -1.294e-6■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 STRBP-205ENST00000471564 535 ntTSL 56.96□□□□□ -1.32e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 NDUFS3-203ENST00000525212 530 ntTSL 26.95□□□□□ -1.32e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 ANKRD17-208ENST00000559367 539 ntTSL 56.74□□□□□ -1.332e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 CS-203ENST00000546585 1803 ntTSL 25.98□□□□□ -1.452e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 MOGS-209ENST00000489655 489 ntTSL 35.95□□□□□ -1.462e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 FMR1-210ENST00000475038 571 ntTSL 55.75□□□□□ -1.492e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 USP10-217ENST00000569925 572 ntTSL 35.67□□□□□ -1.52e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 CHD1-204ENST00000505982 758 ntTSL 35.66□□□□□ -1.52e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 RTF1-203ENST00000473214 475 ntTSL 25.45□□□□□ -1.542e-6■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 STRBP-209ENST00000496533 657 ntTSL 35.31□□□□□ -1.562e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 USP10-214ENST00000567526 330 ntTSL 35.28□□□□□ -1.562e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 LRRFIP2-213ENST00000461672 563 ntTSL 54.41□□□□□ -1.72e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.712e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.782e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 PSTPIP2-205ENST00000591729 569 ntTSL 43.79□□□□□ -1.82e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.832e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 HAUS6-203ENST00000415524 680 ntTSL 23.49□□□□□ -1.852e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 CHD1-207ENST00000511628 599 ntTSL 33.23□□□□□ -1.892e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 RPS6KB2-208ENST00000526268 787 ntTSL 316.95■□□□□ 0.39e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 TARDBP-231ENST00000639599 1283 ntTSL 513.54□□□□□ -0.244e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.324e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 TARDBP-202ENST00000315091 1835 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.674e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 TARDBP-206ENST00000473869 1946 ntTSL 59.54□□□□□ -0.884e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 AL109811.4-201ENST00000614757 1793 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.084e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 EIF5-216ENST00000560877 521 ntTSL 412.39□□□□□ -0.433e-10■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 SLX1A-SULT1A3-204ENST00000567520 2227 ntTSL 219.15■□□□□ 0.665e-12■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 SLX1A-SULT1A3-205ENST00000568997 2834 ntTSL 218.63■□□□□ 0.575e-12■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 SLX1A-206ENST00000565081 1558 ntTSL 218.29■□□□□ 0.525e-12■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 SLX1A-204ENST00000563995 589 ntTSL 317.53■□□□□ 0.45e-12■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.385e-12■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.245e-12■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 SLX1A-SULT1A3-206ENST00000569959 2424 ntTSL 216.08■□□□□ 0.165e-12■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 SLX1A-SULT1A3-201ENST00000561824 1838 ntTSL 215.36■□□□□ 0.055e-12■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.015e-12■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 CTAGE5-216ENST00000556990 568 ntTSL 413.29□□□□□ -0.284e-10■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 CTAGE5-206ENST00000396158 3695 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.564e-10■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 CTAGE5-202ENST00000280083 3860 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.594e-10■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 CTAGE5-203ENST00000341502 4091 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.824e-10■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 CTAGE5-214ENST00000556148 2526 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.894e-10■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 CTAGE5-205ENST00000348007 2762 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.064e-10■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 CTAGE5-213ENST00000555716 558 ntTSL 46.15□□□□□ -1.424e-10■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.554e-10■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.574e-10■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.584e-10■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.64e-10■□□□□ 10.8
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