Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.68e-7■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 PTGES2-204ENST00000474124 873 ntTSL 524.98■■□□□ 1.598e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 PHC2-206ENST00000467894 1466 ntTSL 524.81■■□□□ 1.568e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 ENGASE-210ENST00000585160 284 ntTSL 324.77■■□□□ 1.568e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 PTGES2-207ENST00000483625 898 ntTSL 524.54■■□□□ 1.528e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 RGS14-208ENST00000509289 414 ntTSL 323.92■■□□□ 1.428e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.428e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 KIF13A-211ENST00000507576 529 ntTSL 323.46■■□□□ 1.352e-6■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 DALRD3-212ENST00000492585 561 ntTSL 323.44■■□□□ 1.348e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 PLEKHA4-206ENST00000595867 766 ntTSL 323.21■■□□□ 1.318e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.38e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 TLE2-215ENST00000590101 972 ntTSL 222.61■■□□□ 1.218e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 SH3D21-202ENST00000474766 2043 ntTSL 1 (best)22.39■■□□□ 1.178e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.148e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.128e-7■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 GORASP2-211ENST00000497928 711 ntTSL 522.01■■□□□ 1.118e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 ABHD16A-216ENST00000498420 1137 ntTSL 521.84■■□□□ 1.098e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.048e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.038e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 CCDC61-205ENST00000596161 574 ntTSL 421.43■■□□□ 1.028e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 RRBP1-209ENST00000495501 832 ntTSL 521.35■■□□□ 1.018e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 TLE2-208ENST00000587217 580 ntTSL 421.3■■□□□ 18e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 PARP12-205ENST00000473341 2861 ntTSL 1 (best)21.28■■□□□ 14e-6■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 MINDY2-201ENST00000316848 4866 ntTSL 1 (best)21.26■□□□□ 0.998e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 PLEKHA4-205ENST00000594195 616 ntTSL 221.24■□□□□ 0.998e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.951e-6■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 TLE2-213ENST00000589291 578 ntTSL 420.85■□□□□ 0.938e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 SCRN2-213ENST00000584567 932 ntTSL 220.76■□□□□ 0.911e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 NISCH-209ENST00000485765 563 ntTSL 420.26■□□□□ 0.838e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.838e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 ENGASE-206ENST00000579809 1428 ntTSL 1 (best)20.07■□□□□ 0.88e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 CYC1-203ENST00000528618 831 ntTSL 519.73■□□□□ 0.758e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 AMPD2-213ENST00000524975 678 ntTSL 319.64■□□□□ 0.738e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 TLE2-222ENST00000592584 600 ntTSL 319.64■□□□□ 0.738e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.734e-6■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 GORASP2-205ENST00000455067 530 ntTSL 419.56■□□□□ 0.728e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 ZNF638-226ENST00000494621 871 ntTSL 319.45■□□□□ 0.72e-14■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 CNDP2-214ENST00000581600 500 ntTSL 219.38■□□□□ 0.698e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.688e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.688e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 THOP1-209ENST00000589087 2977 ntTSL 219.22■□□□□ 0.678e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.624e-6■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 ABHD16A-209ENST00000477462 582 ntTSL 318.79■□□□□ 0.68e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 SCRN2-209ENST00000582459 1624 ntTSL 518.77■□□□□ 0.61e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.568e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 TBRG4-208ENST00000478116 641 ntTSL 218.54■□□□□ 0.561e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 GORASP2-204ENST00000454751 624 ntTSL 518.45■□□□□ 0.548e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 RGS14-212ENST00000514102 875 ntTSL 218.34■□□□□ 0.538e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 PTGES2-206ENST00000476748 699 ntTSL 218.31■□□□□ 0.528e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 RGS14-204ENST00000503044 458 ntTSL 218.24■□□□□ 0.518e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 GORASP2-210ENST00000497674 563 ntTSL 218.13■□□□□ 0.498e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 TLE2-207ENST00000587137 559 ntTSL 518.13■□□□□ 0.498e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 GORASP2-203ENST00000444801 568 ntTSL 318.05■□□□□ 0.488e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 SH3D21-203ENST00000480549 3182 ntTSL 218.03■□□□□ 0.488e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 SNX2-211ENST00000512394 763 ntTSL 318■□□□□ 0.478e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 TLE2-216ENST00000590183 556 ntTSL 517.99■□□□□ 0.478e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.468e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 CNOT3-207ENST00000496327 784 ntTSL 517.85■□□□□ 0.458e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.438e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.438e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 TBRG4-211ENST00000482482 486 ntTSL 517.7■□□□□ 0.421e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.428e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 VPS8-222ENST00000475580 318 ntTSL 217.66■□□□□ 0.428e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 SPRED2-207ENST00000452315 1365 ntTSL 1 (best)17.63■□□□□ 0.418e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.418e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 PIK3C2A-204ENST00000532035 584 ntTSL 317.28■□□□□ 0.368e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.348e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 PIK3C2A-203ENST00000531428 1593 ntTSL 1 (best)16.92■□□□□ 0.38e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 TLE2-218ENST00000591457 393 ntTSL 516.65■□□□□ 0.268e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.255e-7■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.255e-7■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 VPS8-213ENST00000453056 661 ntTSL 316.53■□□□□ 0.248e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.238e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 SNRNP48-203ENST00000634363 781 ntTSL 216.42■□□□□ 0.228e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 IDUA-207ENST00000509744 428 ntTSL 316.32■□□□□ 0.28e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 DRD4-202ENST00000528733 361 ntTSL 316.25■□□□□ 0.198e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 OAZ2-208ENST00000560781 540 ntTSL 416.24■□□□□ 0.198e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.198e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 PTGES2-210ENST00000487063 638 ntTSL 316.09■□□□□ 0.178e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.168e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 ZNF638-213ENST00000466330 746 ntTSL 315.88■□□□□ 0.132e-14■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.135e-7■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 VPS8-221ENST00000471655 434 ntTSL 315.83■□□□□ 0.128e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.79■□□□□ 0.128e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 ENGASE-201ENST00000300682 4626 ntTSL 515.43■□□□□ 0.068e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 SDC3-201ENST00000336798 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.061e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.058e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.058e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 ZNF638-212ENST00000464375 626 ntTSL 315.29■□□□□ 0.042e-14■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 ZNF638-216ENST00000475743 590 ntTSL 415.29■□□□□ 0.042e-14■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 RGS14-207ENST00000506944 590 ntTSL 214.82□□□□□ -0.048e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.041e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 CCDC61-203ENST00000594672 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 314.75□□□□□ -0.058e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.051e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 PARP12-209ENST00000489809 915 ntTSL 314.7□□□□□ -0.064e-6■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 CHEK2-210ENST00000416671 2560 ntTSL 1 (best)14.69□□□□□ -0.068e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 ARID4A-206ENST00000431317 5783 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.15e-7■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 BORCS8-MEF2B-205ENST00000602438 576 ntTSL 414.42□□□□□ -0.18e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.111e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 ADCK1-205ENST00000555333 600 ntTSL 414.38□□□□□ -0.118e-8■■■■■ 44.9
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 3218.3 ms