Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH22Q9UJ99 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms