Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms