Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms