Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR4

NIT2, Omega-amidase NIT2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT2Q9NQR4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIT2Q9NQR4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIT2Q9NQR4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms