Protein–RNA interactions for Protein: Q9H361

PABPC3, Polyadenylate-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC3Q9H361 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPC3Q9H361 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PABPC3Q9H361 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PABPC3Q9H361 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PABPC3Q9H361 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PABPC3Q9H361 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PABPC3Q9H361 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PABPC3Q9H361 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PABPC3Q9H361 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PABPC3Q9H361 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PABPC3Q9H361 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PABPC3Q9H361 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PABPC3Q9H361 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PABPC3Q9H361 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PABPC3Q9H361 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PABPC3Q9H361 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PABPC3Q9H361 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PABPC3Q9H361 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PABPC3Q9H361 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PABPC3Q9H361 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC3Q9H361 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC3Q9H361 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC3Q9H361 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC3Q9H361 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC3Q9H361 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC3Q9H361 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC3Q9H361 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC3Q9H361 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC3Q9H361 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC3Q9H361 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC3Q9H361 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC3Q9H361 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms