Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms