Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM7Q9C029 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms