Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP2-4Q9BYR9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms