Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms