Protein–RNA interactions for Protein: Q92764

KRT35, Keratin, type I cuticular Ha5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT35Q92764 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT35Q92764 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT35Q92764 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT35Q92764 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT35Q92764 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT35Q92764 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT35Q92764 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT35Q92764 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT35Q92764 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT35Q92764 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT35Q92764 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT35Q92764 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT35Q92764 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT35Q92764 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT35Q92764 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT35Q92764 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT35Q92764 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT35Q92764 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT35Q92764 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT35Q92764 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT35Q92764 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT35Q92764 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT35Q92764 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT35Q92764 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT35Q92764 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT35Q92764 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT35Q92764 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT35Q92764 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT35Q92764 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT35Q92764 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT35Q92764 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT35Q92764 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT35Q92764 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT35Q92764 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT35Q92764 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT35Q92764 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT35Q92764 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT35Q92764 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT35Q92764 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT35Q92764 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT35Q92764 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT35Q92764 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT35Q92764 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT35Q92764 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT35Q92764 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT35Q92764 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT35Q92764 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT35Q92764 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms