Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG16L2Q8NAA4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms