Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y13

DZIP3, E3 ubiquitin-protein ligase DZIP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DZIP3Q86Y13 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DZIP3Q86Y13 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DZIP3Q86Y13 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DZIP3Q86Y13 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DZIP3Q86Y13 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DZIP3Q86Y13 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DZIP3Q86Y13 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DZIP3Q86Y13 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms