Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZBED9Q6R2W3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms