Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms