Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC6LQ2NKX8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms