Protein–RNA interactions for Protein: Q17R31

TATDN3, Putative deoxyribonuclease TATDN3, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TATDN3Q17R31 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TATDN3Q17R31 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TATDN3Q17R31 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TATDN3Q17R31 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TATDN3Q17R31 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TATDN3Q17R31 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TATDN3Q17R31 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TATDN3Q17R31 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TATDN3Q17R31 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TATDN3Q17R31 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TATDN3Q17R31 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TATDN3Q17R31 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TATDN3Q17R31 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TATDN3Q17R31 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TATDN3Q17R31 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms