Protein–RNA interactions for Protein: Q14781

CBX2, Chromobox protein homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX2Q14781 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
CBX2Q14781 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX2Q14781 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX2Q14781 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX2Q14781 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX2Q14781 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX2Q14781 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX2Q14781 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX2Q14781 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX2Q14781 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX2Q14781 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX2Q14781 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX2Q14781 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX2Q14781 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX2Q14781 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX2Q14781 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX2Q14781 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX2Q14781 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX2Q14781 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX2Q14781 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBX2Q14781 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
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