Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
COL4A6Q14031 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
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COL4A6Q14031 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A6Q14031 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
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