Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD4Q13485 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD4Q13485 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD4Q13485 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD4Q13485 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD4Q13485 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD4Q13485 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD4Q13485 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD4Q13485 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD4Q13485 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD4Q13485 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD4Q13485 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD4Q13485 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD4Q13485 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD4Q13485 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD4Q13485 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD4Q13485 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD4Q13485 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD4Q13485 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD4Q13485 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD4Q13485 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD4Q13485 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD4Q13485 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD4Q13485 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD4Q13485 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD4Q13485 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD4Q13485 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD4Q13485 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD4Q13485 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD4Q13485 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD4Q13485 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD4Q13485 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD4Q13485 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD4Q13485 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD4Q13485 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD4Q13485 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms