Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SP140Q13342 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SP140Q13342 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SP140Q13342 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SP140Q13342 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SP140Q13342 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SP140Q13342 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SP140Q13342 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SP140Q13342 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SP140Q13342 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SP140Q13342 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SP140Q13342 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SP140Q13342 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SP140Q13342 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SP140Q13342 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SP140Q13342 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SP140Q13342 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SP140Q13342 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SP140Q13342 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SP140Q13342 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SP140Q13342 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SP140Q13342 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SP140Q13342 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SP140Q13342 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SP140Q13342 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SP140Q13342 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SP140Q13342 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SP140Q13342 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SP140Q13342 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SP140Q13342 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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SP140Q13342 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SP140Q13342 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
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SP140Q13342 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SP140Q13342 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SP140Q13342 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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SP140Q13342 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SP140Q13342 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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SP140Q13342 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SP140Q13342 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SP140Q13342 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SP140Q13342 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SP140Q13342 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SP140Q13342 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SP140Q13342 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SP140Q13342 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SP140Q13342 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SP140Q13342 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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SP140Q13342 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SP140Q13342 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SP140Q13342 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SP140Q13342 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SP140Q13342 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SP140Q13342 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SP140Q13342 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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SP140Q13342 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SP140Q13342 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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SP140Q13342 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
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SP140Q13342 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SP140Q13342 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SP140Q13342 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SP140Q13342 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SP140Q13342 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SP140Q13342 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SP140Q13342 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SP140Q13342 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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SP140Q13342 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SP140Q13342 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SP140Q13342 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SP140Q13342 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SP140Q13342 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SP140Q13342 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SP140Q13342 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SP140Q13342 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SP140Q13342 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SP140Q13342 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SP140Q13342 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SP140Q13342 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SP140Q13342 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SP140Q13342 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SP140Q13342 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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