Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TWF1Q12792 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TWF1Q12792 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TWF1Q12792 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TWF1Q12792 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TWF1Q12792 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TWF1Q12792 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TWF1Q12792 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TWF1Q12792 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TWF1Q12792 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
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