Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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GTF3C1Q12789 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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GTF3C1Q12789 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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GTF3C1Q12789 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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GTF3C1Q12789 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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GTF3C1Q12789 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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