Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms