Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CDK6Q00534 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK6Q00534 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms