Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRX1P78414 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRX1P78414 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRX1P78414 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRX1P78414 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRX1P78414 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRX1P78414 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRX1P78414 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRX1P78414 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRX1P78414 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRX1P78414 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRX1P78414 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRX1P78414 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRX1P78414 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRX1P78414 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRX1P78414 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRX1P78414 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRX1P78414 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRX1P78414 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRX1P78414 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRX1P78414 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRX1P78414 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRX1P78414 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRX1P78414 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRX1P78414 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRX1P78414 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRX1P78414 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRX1P78414 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRX1P78414 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRX1P78414 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRX1P78414 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
IRX1P78414 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRX1P78414 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRX1P78414 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRX1P78414 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRX1P78414 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRX1P78414 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRX1P78414 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRX1P78414 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRX1P78414 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
IRX1P78414 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IRX1P78414 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IRX1P78414 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IRX1P78414 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRX1P78414 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRX1P78414 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRX1P78414 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRX1P78414 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRX1P78414 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRX1P78414 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRX1P78414 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRX1P78414 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRX1P78414 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRX1P78414 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRX1P78414 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
IRX1P78414 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRX1P78414 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRX1P78414 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
IRX1P78414 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRX1P78414 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRX1P78414 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRX1P78414 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRX1P78414 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRX1P78414 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRX1P78414 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRX1P78414 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRX1P78414 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRX1P78414 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRX1P78414 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRX1P78414 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRX1P78414 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRX1P78414 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRX1P78414 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRX1P78414 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRX1P78414 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRX1P78414 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRX1P78414 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRX1P78414 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRX1P78414 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRX1P78414 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRX1P78414 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRX1P78414 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRX1P78414 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRX1P78414 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
IRX1P78414 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRX1P78414 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
IRX1P78414 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRX1P78414 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRX1P78414 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRX1P78414 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRX1P78414 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRX1P78414 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRX1P78414 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRX1P78414 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRX1P78414 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRX1P78414 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRX1P78414 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRX1P78414 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRX1P78414 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
IRX1P78414 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms